Проекты Version Cue хранятся на серверах Version Cue. В проектах хранятся основные копии файлов, входящих в состав проекта, а также версии файлов и другие данные файлов, включая сведения о версиях и комментарии. Если сервер Version Cue настроен как видимый, а проекты являются общими, множество пользователей может обращаться к проектам, содержащим файлы как Adobe, так и не Adobe.

Когда проект Version Cue открывается впервые, в папке "Мои документы" (Windows) или "Documents" (Mac OS) создается подпапка "Version Cue", а внутри нее – подпапка с именем проекта. Программа Version Cue создает также ссылку на проект, которая отображается в программе Bridge и в диалоговом окне Adobe, если щелкнуть значок Version Cue в "Избранное".

Создавать и администрировать проекты можно только при наличии соответствующих прав доступа, предоставленных в системе администрирования сервера Version Cue.