Проекти Version Cue зберігаються на серверах Version Cue. Проекти зберігають головні копії файлів, доданих до проекту, а також версії файлів та інші дані про файли, наприклад дати версій та коментарі. Якщо сервер Version Cue є видимим та містить спільні проекти, то декілька користувачів можуть працювати з проектами, що містять як файли створені за допомогою продуктів Adobe, так і за допомогою інших програм.

Коли ви відкриваєте проект Version Cue вперше, Version Cue створює теку з назвою "Version Cue" в теці "Мої документи" (Windows) або "Документи" (Mac OS) і додає теку проектів до теки Version Cue. Також Version Cue створює посилання на проект, що з'являється в Bridge та в діалоговому вікні Adobe після того, як буде клацнуто значок обраного Version Cue.

Проекти можна створити та адмініструвати, тільки якщо необхідні права доступу були надані в адмініструванні сервера Version Cue.