Під час праці з проектами, що розташовані на різних серверах Version Cue, але мають однакове ім'я Version Cue може створити, як спочатку здається, декілька копій теки локальних файлів проекту, але насправді це теки локальних файлів двох різних проектів, що знаходяться на різних серверах. Version Cue називає теки іменем проекту та додає номер (наприклад, project_001, project_002). Можна видалити ці теки після збереження версій локальних файлів проекту на сервері Version Cue. (Або просто ігнорувати їх.)
Щоб видалити теки локальних файлів проекту, скористайтеся Adobe Bridge для відключення від кожного проекту (див. Відключення від проектів).